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【計算深度解讀】ASS:DFT研究吸附構(gòu)型、吸附能和電子性質(zhì),探索礦物溶解機制

【計算深度解讀】ASS:DFT研究吸附構(gòu)型、吸附能和電子性質(zhì),探索礦物溶解機制

橄欖石型礦物是可用于大量二氧化碳封存的礦物,因為它廣泛地分布在世界各地。然而,礦物溶解速率是限制其二氧化碳封存過程的關(guān)鍵因素。

近日,通過將第一性原理計算與掃描電子顯微鏡(SEM)相結(jié)合,南京工業(yè)大學王倩倩等人研究了促進Mg2SiO4礦物溶解機制的不同類型的有機酸,包括吸附構(gòu)型、吸附能和電子性質(zhì)。

模型與計算方法

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圖1. 具有標記原子的鎂橄欖石的總態(tài)密度和部分態(tài)密度(PDOS)以及優(yōu)化的體結(jié)構(gòu)

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圖2.(a)Mg2SiO4(0 1 0)表面模型的原子排列(b)沿表面垂直方向的靜電勢分布

如圖1所示,Mg2SiO4的帶隙為4.996?eV,而(0 1 0)表面是自然界中橄欖石礦物最主要的晶體表面,也是最穩(wěn)定的表面。

對于有機酸分子吸附計算,作者構(gòu)建了在周期性方向上10?×?10??的平板模型,并設(shè)置了20??的真空層,具體如圖2(a)所示。在弛豫過程中,板中的上下兩層Mg-SiO4被固定。如圖2(b)所示,通過靜電勢分布預測所建表面模型的合理性。

弛豫后,真空層上下表面的靜電勢在中間位置達到真空水平,表明真空層具有有足夠的厚度,從而實現(xiàn)上表面和下表面之間的相互作用可以忽略不計。

計算過程由兩個過程完成。首先,基于蒙特卡洛模擬退火方法,運用Materials Studio中的吸附定位器,以搜索表面吸附物(有機酸分子,即乙酸、草酸和檸檬酸)的能量最小化吸附構(gòu)型。

然后,使用第一性原理計算方法研究了表面與不同類型有機酸分子之間的相互作用,且運用Materials Studio(Accelrys software Inc)軟件中的DMol3模塊進行密度泛函理論(DFT)計算。

在預測過程中,可以用不同的能量獲得不同有機酸分子(乙酸、草酸和檸檬酸)在Mg2SiO4(0 1 0)表面上的吸附位置和構(gòu)型。選擇表面模型的頂部Mg原子和硅酸鹽基團作為目標原子,最大吸附距離為10??. 應(yīng)用COMPASS II力場。Ewald方法用于靜電相互作用,范德華相互作用截止半徑設(shè)置為15.5??.

對于DMol3模塊中的參數(shù)設(shè)置,運用廣義梯度近似(GGA)中的Perdew Burke Ernzerhof sol(PBEsol)泛函來處理交換關(guān)聯(lián)相互作用,并采用TS方法的(DFT-D)色散校正。

此外,作者采用全電子計算,以及采用雙數(shù)值加極化(DNP)基組求解自洽場方程。對于第一布里淵區(qū),作者使用Monkhorst Pack方法來構(gòu)建k點網(wǎng)格。自洽迭代收斂標準和能量收斂標準分別設(shè)置為1.0?×?10?6 Hartree和1.0?×? 10?5 Hartree。最大應(yīng)力設(shè)定為低于2.0?×?10?3 Hartree??1

結(jié)果與討論
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圖3. 吸附定位器模塊預測的(a)乙酸(b)草酸(c)檸檬酸吸附能勢能面
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圖4.(a,a′)乙酸、(b,b′)草酸、(c,c′)檸檬酸和(d,d′)Mg2SiO4(0 1 0)的HOMO和LUMO的體積分布。
如圖3所示,根據(jù)吸附定位器模塊預測的吸附能勢能面,作者可以發(fā)現(xiàn)檸檬酸的吸附位點最多?;谇把胤肿榆壍览碚?,當一個分子的HOMO和另一個分子LUMO之間存在最大重疊時,更可能發(fā)生化學反應(yīng)。
乙酸分子和草酸分子的HOMO主要分布在羧基的羰基O(Ocar)上,而檸檬酸分子最廣泛地分布在羧基和羥基上(圖4(a)、(b)和(c))。乙酸分子和草酸分子的LUMO主要分布在羧基的C原子上,而檸檬酸分子分布在端基的一個羧基上(圖4(a’)、(b’)和(C’))。
在圖4(d)和(d’)中Mg2SiO4(0 1 0)表面上,LUMO主要分布在表面上的Mg原子周圍,而HOMO則分布在表面二氧化硅四面體中的O原子周圍。
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圖5.(a)和(b)、(c)和(d)、(e)和(f)分別為乙酸分子、草酸分子和檸檬酸分子在Mg2SiO4(010)表面上吸附的兩種吸附構(gòu)型。
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圖6. 有機酸分子吸附后,頂部表面Mg原子在z方向上的位移
從圖5中的吸附構(gòu)型來看,乙酸分子分別是垂直的和側(cè)向的;草酸分子均位于表面;檸檬酸分子分別為“Y”型和“T”型。有機酸分子羧基中的H-O鍵在一定程度上被拉伸,A1構(gòu)型除外(圖5中用矩形標記),這是因為A1的吸附能的絕對值最小。
A2、O2和C1的Ocar和Ooxh與表面上的Mg原子相互作用使它們具有更負的吸附能。有機酸分子吸附后頂部表面上鎂原子的位移如圖6所示,當鎂原子與有機酸分子相互作用時,它們明顯向外移動。
此外,由于有機酸分子在表面上的吸附能較低,鎂原子的位移會較大。在所有吸附構(gòu)型中,檸檬酸分子具有最多的羧基,并且C1吸附構(gòu)型具有所有研究構(gòu)型中與表面相互作用的最多原子。
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圖7.(a)A1(b)A2(c)O1(d)O2(e)C1(f)C2吸附構(gòu)型的差分電荷密度
如圖7所示,可以觀察到在有機酸分子吸附后,表面吸附位點周圍的差分電荷密度明顯極化。Ocar、Ooxh和Os周圍的差分電荷密度幾乎是黃色的,而Hoxh的情況是藍色的。
如果有機酸分子羧基中的H-Ooxh鍵被拉伸到一定程度,則此處的差分電荷密度將被極化(圖7中用矩形標記)。同時,Ocar會與表面Mg離子發(fā)生電荷密度轉(zhuǎn)移,從而形成一定的化學鍵。
重要的是,Ocar在破壞羧基中的H-O鍵以釋放H+方面起著重要作用,這對礦物溶解反應(yīng)很重要。
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圖8. 有機酸分子與Mg(OH)2基團之間的絡(luò)合反應(yīng)路徑(a)乙酸(b)草酸(c)檸檬酸(M:Mg(OH)2基團,A:乙酸,O:草酸,C:檸檬酸;實線表示自發(fā)反應(yīng)路徑,虛線表示非自發(fā)反應(yīng)路徑;紅字是基本反應(yīng)的吉布斯自由能,單位為kJ/mol)

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圖9. 有機酸分子與Si(OH)4基團之間的絡(luò)合反應(yīng)路徑(a)乙酸(b)草酸(c)檸檬酸(S:Si(OH)3基團,A:乙酸,O:草酸,C:檸檬酸;實線表示自發(fā)反應(yīng)路徑,而虛線表示非自發(fā)反應(yīng)路徑;紅字是基本反應(yīng)的吉布斯自由能,單位為kJ/mol)
如圖8和圖9所示,作者分別考慮了有機酸分子與Mg(OH)2/Si(OH)4之間的不同化學反應(yīng)路徑以及不同類型的配合物。
ΔG值分析表明,Mg2SiO4(0 1 0)表面的有機酸促進溶解機制主要是由于Mg離子與有機酸分子之間的絡(luò)合作用。具有羥基和羧基的有機酸分子可以容易地與Mg2+反應(yīng),形成水溶性金屬-有機絡(luò)合物。
此外,檸檬酸與橄欖石表面之間存在更多的反應(yīng)路徑,并且它們具有更多的負ΔG。檸檬酸具有最多的羧基羥基,表明其是提高礦物溶解速率的最佳選擇。
結(jié)論與展望
作者通過熱力學計算研究了有機酸分子與Mg(OH)2或Si(OH)4基團之間絡(luò)合路徑。
結(jié)果表明,有機酸分子通過電荷轉(zhuǎn)移和軌道雜化吸附到橄欖石表面后,橄欖石表面的陽離子更傾向于與羧基羰基O成鍵。羧基中的H-O鍵將被破壞使礦物表面羥基化。更多的羧基將有利于礦物溶解,出現(xiàn)更多的蝕坑。
通過熱力學計算,由電離有機酸分子和Mg2+形成的多種類型的配合物以不同的反應(yīng)路徑和吉布斯自由能共存。
該工作首次預測了溶解陽離子與羧酸根羰基O之間的強烈相互作用,有助于尋找合理的添加劑以改善礦物溶解動力學過程。
文獻信息
Sun C, Yao Z, Wang Q, et al. Theoretical study on the organic acid promoted dissolution mechanism of forsterite mineral[J]. Applied Surface Science, 2022: 156063.

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