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被催了億次的組分間的氫鍵統(tǒng)計(jì)腳本！數(shù)量、鍵長(zhǎng)、鍵角隨時(shí)間變化、PDF都包含，手把手教你怎么用！

? 計(jì)算 ? 閱讀 26
在MS計(jì)算中，氫鍵分析絕對(duì)稱得上是各大領(lǐng)域的頂流，在對(duì)玻璃、金屬氧化物、礦物表面、石墨烯、磷脂雙層等體系的潤(rùn)濕性、疏水性、摩擦系數(shù)的研究都有其用武之地。
不久之前，楊老師寫(xiě)過(guò)一個(gè)氫鍵統(tǒng)計(jì)①號(hào)腳本，受到了學(xué)員們的廣泛應(yīng)用，它大大減少了我們?cè)诜肿觿?dòng)力學(xué)計(jì)算中的重復(fù)性工作。畢竟，分子動(dòng)力學(xué)軌跡動(dòng)輒就是10000幀，每一幀都包含10-1000根氫鍵。
然而，在學(xué)員們的實(shí)際應(yīng)用中，楊老師也發(fā)現(xiàn)，如果只統(tǒng)計(jì)所有分子間信息的話，就失去了細(xì)節(jié)。視頻評(píng)論區(qū)有很多小虎斑反饋，更想分析片段和片段、組分和組分間的氫鍵結(jié)合信息。
對(duì)此，楊老師只想說(shuō)，你們盡管照搬，2.0版本的氫鍵腳本馬上安排，還完全免費(fèi)！
所以氫鍵腳本②號(hào)已經(jīng)新鮮出爐了，功能更加強(qiáng)大（見(jiàn)下方），來(lái)滿足大家進(jìn)一步的需求！

被催了億次的組分間的氫鍵統(tǒng)計(jì)腳本！數(shù)量、鍵長(zhǎng)、鍵角隨時(shí)間變化、PDF都包含，手把手教你怎么用！

氫鍵②號(hào)腳本：
  • 不但能給出氫鍵的數(shù)量，還能給出其隨時(shí)間的變化！
  • 不但能統(tǒng)計(jì)所有氫鍵的鍵長(zhǎng)、鍵角，還能給出它們?cè)诿恳粋€(gè)長(zhǎng)度區(qū)間、角度區(qū)間的分布，直接畫(huà)出圖來(lái)，做進(jìn)一步的分析！
  • 不但能通過(guò)受主元素（如O、N、F）對(duì)氫鍵進(jìn)行分類討論，而且能區(qū)分片段內(nèi)部（intra-set）與片段間(inter-sets)的氫鍵，還可以處理多個(gè)片段、組分的結(jié)構(gòu)！

本期特訓(xùn)內(nèi)容包括：

? 氫鍵判據(jù)（長(zhǎng)度、角度）與潤(rùn)濕性
? 氣固、固液界面、液體、聚合物、煤分子建模與分子動(dòng)力學(xué)模擬
? 上述體系的氫鍵數(shù)量隨時(shí)間的演化
? 上述體系的各組分間的氫鍵平均長(zhǎng)度隨時(shí)間的演化
–————————-二、三區(qū)分割線—————————-
? 組分間氫鍵長(zhǎng)度、角度的Probability Distribution Function
? PMF (Potential of Mean Force)與Free energy landscape與PDF的聯(lián)系
主辦單位：深圳華算科技有限公司
課程形式：12月5日直播、完全免費(fèi)、提供回放！
課程目標(biāo)：MS腳本實(shí)現(xiàn)各類組分間的氫鍵數(shù)量、長(zhǎng)度、角度隨時(shí)間演化與PDF分布統(tǒng)計(jì)！
上課方式：添加下方助教微信，入群聽(tīng)課！獲取直播鏈接、往期視頻、課件、答疑等！
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 課程圖片

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固液界面分子動(dòng)力學(xué)
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聚合物-水界面

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磷脂雙層
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氫鍵鍵長(zhǎng)、鍵角定義

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氫鍵數(shù)量隨MD時(shí)間的演化

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氫鍵PDF、壽命
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鍵長(zhǎng)、鍵角Probability Distribution Function

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氫鍵PDF、PMF與自由能

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自由能與氫鍵鍵長(zhǎng)、鍵角的聯(lián)合分布

 MS腳本特訓(xùn)營(yíng)課程內(nèi)容

MS特訓(xùn)營(yíng)，共講解21款腳本，15小時(shí)課程！
純干貨，快上車！??????

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