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被催了億次的組分間的氫鍵統(tǒng)計腳本！數(shù)量、鍵長、鍵角隨時間變化、PDF都包含，手把手教你怎么用！

? 計算 ? 閱讀 143
在MS計算中，氫鍵分析絕對稱得上是各大領(lǐng)域的頂流，在對玻璃、金屬氧化物、礦物表面、石墨烯、磷脂雙層等體系的潤濕性、疏水性、摩擦系數(shù)的研究都有其用武之地。
不久之前，楊老師寫過一個氫鍵統(tǒng)計①號腳本，受到了學(xué)員們的廣泛應(yīng)用，它大大減少了我們在分子動力學(xué)計算中的重復(fù)性工作。畢竟，分子動力學(xué)軌跡動輒就是10000幀，每一幀都包含10-1000根氫鍵。
然而，在學(xué)員們的實際應(yīng)用中，楊老師也發(fā)現(xiàn)，如果只統(tǒng)計所有分子間信息的話，就失去了細節(jié)。視頻評論區(qū)有很多小虎斑反饋，更想分析片段和片段、組分和組分間的氫鍵結(jié)合信息。
對此，楊老師只想說，你們盡管照搬，2.0版本的氫鍵腳本馬上安排，還完全免費！
所以氫鍵腳本②號已經(jīng)新鮮出爐了，功能更加強大（見下方），來滿足大家進一步的需求！

被催了億次的組分間的氫鍵統(tǒng)計腳本！數(shù)量、鍵長、鍵角隨時間變化、PDF都包含，手把手教你怎么用！

氫鍵②號腳本：
  • 不但能給出氫鍵的數(shù)量，還能給出其隨時間的變化！
  • 不但能統(tǒng)計所有氫鍵的鍵長、鍵角，還能給出它們在每一個長度區(qū)間、角度區(qū)間的分布，直接畫出圖來，做進一步的分析！
  • 不但能通過受主元素（如O、N、F）對氫鍵進行分類討論，而且能區(qū)分片段內(nèi)部（intra-set）與片段間(inter-sets)的氫鍵，還可以處理多個片段、組分的結(jié)構(gòu)！

本期特訓(xùn)內(nèi)容包括：

? 氫鍵判據(jù)（長度、角度）與潤濕性
? 氣固、固液界面、液體、聚合物、煤分子建模與分子動力學(xué)模擬
? 上述體系的氫鍵數(shù)量隨時間的演化
? 上述體系的各組分間的氫鍵平均長度隨時間的演化
–————————-二、三區(qū)分割線—————————-
? 組分間氫鍵長度、角度的Probability Distribution Function
? PMF (Potential of Mean Force)與Free energy landscape與PDF的聯(lián)系
主辦單位：深圳華算科技有限公司
課程形式：12月5日直播、完全免費、提供回放！
課程目標(biāo)：MS腳本實現(xiàn)各類組分間的氫鍵數(shù)量、長度、角度隨時間演化與PDF分布統(tǒng)計！
上課方式：添加下方助教微信，入群聽課！獲取直播鏈接、往期視頻、課件、答疑等！
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 課程圖片

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固液界面分子動力學(xué)
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聚合物-水界面

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磷脂雙層
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氫鍵鍵長、鍵角定義

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氫鍵數(shù)量隨MD時間的演化

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鍵長、鍵角Probability Distribution Function

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自由能與氫鍵鍵長、鍵角的聯(lián)合分布

 MS腳本特訓(xùn)營課程內(nèi)容

MS特訓(xùn)營，共講解21款腳本，15小時課程！
純干貨，快上車！??????

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