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【AI+DFT計(jì)算】Nanoscale:機(jī)器學(xué)習(xí)對合金結(jié)構(gòu)和電子特征工程的析氫反應(yīng)催化劑進(jìn)行預(yù)測

【AI+DFT計(jì)算】Nanoscale:機(jī)器學(xué)習(xí)對合金結(jié)構(gòu)和電子特征工程的析氫反應(yīng)催化劑進(jìn)行預(yù)測
研究背景
由于氫燃燒后二氧化碳排放量接近零,因此,氫成為了一種可持續(xù)能源。水電解制氫與傳統(tǒng)的甲烷蒸汽重整相比,可以實(shí)現(xiàn)低碳制氫,但水電解需要高性能催化劑來促進(jìn)析氫反應(yīng)(HER),二元合金已證明對HER具有高活性的催化性能,但由于合金催化劑有巨大組合空間,給實(shí)驗(yàn)和計(jì)算探索方面帶來了重大挑戰(zhàn)。因此,隨著機(jī)器學(xué)習(xí)(ML)的發(fā)展,ML可以加速電催化劑材料設(shè)計(jì),減少實(shí)驗(yàn)和計(jì)算資源的耗費(fèi)。
近日,哈爾濱工業(yè)大學(xué)胡凱龍和Xi Lin等人通過結(jié)合合金的電子和結(jié)構(gòu)特性,構(gòu)建了準(zhǔn)確的ML模型,并用于預(yù)測HER的高性能合金催化劑,估計(jì)了合金特征對ΔGH*值的平均邊際貢獻(xiàn),以確定預(yù)測過程中各種特征的重要性。此外,從材料項(xiàng)目(MP)數(shù)據(jù)庫中成功篩選出84種|ΔGH*|值小于0.1eV的合金,并利用DFT方法進(jìn)一步驗(yàn)證了ML模型的預(yù)測精度,為加速高性能合金析氫催化劑的成分設(shè)計(jì)提供了可解釋的見解。
模型與計(jì)算方法
本文采用VASP軟件進(jìn)行了自旋極化DFT計(jì)算。在廣義梯度近似(GGA)下,通過Perdew–Burke–Ernzerhof(PBE)方法計(jì)算了電子-離子相互作用,總能量變化和力的收斂條件分別小于1×10?5 eV和0.01 eV??2。金屬原子的核心電子采用了PAW方法,平面波基組的截?cái)嗄茉O(shè)置為500eV,同時采用4×4×1的k點(diǎn)網(wǎng)格進(jìn)行平板弛豫和吸附,真空層厚度為15?。
結(jié)果與討論
首先,從催化平臺catalysis hub數(shù)據(jù)庫中提取8856條HER合金的化學(xué)成分和適當(dāng)?shù)?em>ΔGH*值。接下來,通過特征工程將數(shù)據(jù)集轉(zhuǎn)換為包含280個特征的數(shù)據(jù)集。
隨后,使用Pearson相關(guān)系數(shù)法選擇了86個相關(guān)特征,并構(gòu)建六個不同的ML回歸模型,并通過Shapley估計(jì)了特征的平均邊際貢獻(xiàn),同時利用ML模型進(jìn)行ΔGH*預(yù)測。
最后,使用性能最優(yōu)的LGB模型鑒定出86種具有潛在HER性質(zhì)的材料。隨后,使用DFT計(jì)算研究了四種潛在的HER合金,具體流程如圖1所示。
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圖1. ML加速二元合金的HER催化活性預(yù)測的工作流程
本文的數(shù)據(jù)集由8856條合金催化數(shù)據(jù)組成,包括ΔGH*值、化學(xué)成分和吸附位點(diǎn),該數(shù)據(jù)集包含L10和L12合金,分別對應(yīng)于AB和A3B的面心立方(FCC)晶體結(jié)構(gòu)。
AB和A3B合金材料的ΔGH*值被繪制為金屬A和B的函數(shù),如圖2顯示了數(shù)據(jù)集中最穩(wěn)定的吸附位點(diǎn)。
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圖2.(a)AB型合金表面的ΔGH*值(b)A3B型合金表面的ΔGH*
本文將單個電子和元素特性轉(zhuǎn)化為化合物特征,并創(chuàng)建了結(jié)構(gòu)吸附位點(diǎn)特征。為了創(chuàng)建可靠的化合物特征,首先通過收集電子成分的信息來收集電子特征。其次,根據(jù)已有的信息提取化學(xué)和物理性質(zhì)。第三,使用化合物元素組成比的one-hot coding方法來反映化學(xué)計(jì)量特征。隨后通過分析和統(tǒng)計(jì)方法進(jìn)行了編碼,將電子和元素特性轉(zhuǎn)換為化合物特征。
合金表面結(jié)構(gòu)在探索HER催化效應(yīng)方面發(fā)揮了重要作用。如圖3特征熱圖所示,展示了合金組分元素與數(shù)據(jù)集中最穩(wěn)定吸附位點(diǎn)之間的關(guān)系。
本文將特征的吸附位點(diǎn)分為三種類型,通過LabelEncode方法編碼分為位點(diǎn)S1、位點(diǎn)S2和位點(diǎn)S3。S1特征包括頂位、橋位和端位的信息。S2特征描述了吸附位點(diǎn)周圍原子的位置,吸附物質(zhì)H在吸附位點(diǎn)原子之間的具體表示被編碼為S3。此外,使用MinMaxScaler包來減輕數(shù)據(jù)范圍和維度對ML模型的影響。
總體而言,該數(shù)據(jù)集包括277個元素性質(zhì)特征和編碼的三個結(jié)構(gòu)位點(diǎn)特征,因此,特征工程過程總共生成了280個初始特征。
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圖3.(a)AB和(b)A3B合金表面的優(yōu)化H吸附位點(diǎn)。
在特征之間存在共線的情況下,ML模型遇到了不穩(wěn)定性,難以準(zhǔn)確建立特征之間的相關(guān)性及其對標(biāo)簽的影響。因此,刪除模型中的冗余特征是必不可少的。
本文采用Pearson相關(guān)系數(shù)指數(shù)用于表示數(shù)值特征與ΔGH*值之間的相關(guān)性。當(dāng)皮爾遜相關(guān)系數(shù)絕對值達(dá)到0.9時,所選擇的特征數(shù)量相對合適,并且模型R2高于其他條件。當(dāng)相關(guān)系數(shù)達(dá)到0.95時,測試模型R2只能達(dá)到0.921,接近相關(guān)系數(shù)的0.90,如表1所示。
為了防止多重共線性導(dǎo)致的過擬合,選擇了少量特征,確保模型中沒有多余的特征。最后,本文保留了86個特征。
表1. 皮爾遜相關(guān)系數(shù)法選擇特征數(shù)
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接下來對數(shù)據(jù)進(jìn)行6種機(jī)器學(xué)習(xí)模型預(yù)測,其中LGB模型預(yù)測結(jié)果與DFT計(jì)算結(jié)果顯示出良好的一致性,在整個數(shù)據(jù)集上顯示出線性關(guān)系,這證明了LGB模型的高精度,有效地學(xué)習(xí)了數(shù)據(jù)集中的所有重要信息。
在LGB訓(xùn)練模型中RMSE僅為0.037eV,R2得分為0.99,XGB和RFR模型的R2得分分別為0.911和0.886,排名第二和第三,SVR、GBDT和KNN模型的R2分?jǐn)?shù)分別為0.856、0.798和0.556,如圖4所示。因此,選擇LGB模型進(jìn)行后續(xù)預(yù)測和特征重要性分析。
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圖4. 使用(a)LGB模型(b)XGB模型(c)RFR模型(d)SVR模型(e)GBDT模型和(f)KNN模型對預(yù)測和DFT計(jì)算的ΔGH*值進(jìn)行比較
SHAP方法提供了影響預(yù)測單個特征的值,并用于估計(jì)合金特征對ΔGH*值的平均邊際貢獻(xiàn)。本文基于SHAP值對特征重要性進(jìn)行了排序,為重要特征的提取提供了新的見解。LGB模型具有較高的預(yù)測性能(R2>0.92),被選擇用于SHAP估計(jì)。SHAP值可用于評估ΔGH*值與合金特征之間的相關(guān)性。
圖5a表示了影響程度是由數(shù)據(jù)集中所有數(shù)據(jù)點(diǎn)的平均絕對SHAP值決定的,顯示了20個最重要的功能。此外,圖5b和c繪制了數(shù)據(jù)集中每個合金ΔGH*的SHAP值,進(jìn)一步驗(yàn)證兩個重要元素特征的影響。
圖5b顯示了平均組數(shù)的臨界范圍(Mc高于7.5),其中SHAP值幾乎都是正的。根據(jù)目前的LGB模型,預(yù)測的ΔGH*將隨著平均組數(shù)的增加而增加。同樣,小于1300°C的平均熔點(diǎn)將提高HER合金材料的ΔGH*(圖5c)。
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圖5.(a)LGB模型的全局解釋(平均特征重要性)和局部解釋(SHAP值分布)(b)Mc特征(合金中元素的基團(tuán)數(shù)的平均值)和(c)Mp特征(元素在合金中的熔點(diǎn)的平均值)的合金催化數(shù)據(jù)的SHAP值
五個特征的平均絕對SHAP值被用作HER合金數(shù)據(jù)庫上回歸的輸入(表2),其中Mc對ΔGH*值預(yù)測的影響最大,其次是S2、Mp,S1和Md。
前四個特征的平均絕對SHAP值大于0.1eV 。在分析了前五個最重要的特征后,帶有LGB模型的SHAP方法成功地捕捉到了合金的元素特征、結(jié)構(gòu)位點(diǎn)特征和電子特征。這一發(fā)現(xiàn)為進(jìn)一步分析影響ΔGH*的特征重要性奠定了基礎(chǔ)。
表2. ΔGH*預(yù)測LGB模型選擇特征的排序平均絕對SHAP值
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為了評估模型的穩(wěn)定性,研究了LGB、XGB、RFR和SVR模型的預(yù)測精度對訓(xùn)練數(shù)據(jù)集大小的依賴性(圖6a)。當(dāng)使用8000個數(shù)據(jù)點(diǎn)進(jìn)行訓(xùn)練時,LGB模型獲得了0.245eV的最低RMSE值,與其他模型相比,其準(zhǔn)確性更高。
此外,為了證明預(yù)測的可靠性,ML模型進(jìn)行了交叉驗(yàn)證偏差評估,學(xué)習(xí)曲線當(dāng)達(dá)到10倍交叉驗(yàn)證的指定平均R2分?jǐn)?shù)時停止(圖6b),10倍交叉驗(yàn)證曲線顯示,LGB模型的平均R2得分為0.921,高于XGB(0.911)、RFR(0.886)和SVR(0.814)模型。
隨后,使用得分最高的LGB模型預(yù)測從MP數(shù)據(jù)庫中篩選了2290個數(shù)據(jù)催化劑的ΔGH*值,具有2290個數(shù)據(jù)ΔGH*分布的重要特征Mc揭示了明顯的線性關(guān)系(圖6c)。當(dāng)Mc特征在1.0到4.5之間時,ΔGH*預(yù)測更接近0.0 eV。同時,為了與實(shí)驗(yàn)建立更強(qiáng)的聯(lián)系,通過計(jì)算ΔGH*值來獲得過電勢。
理論過電位值和ΔGH*之間的關(guān)系為ηHER=?|ΔGH*|/e,表3提供了數(shù)據(jù)集中四種HER合金催化劑的過電位值的比較。ΔGH*絕對值≤0.1eV的范圍被選為有效HER的理想?yún)^(qū)域,其與ΔGH*=0eV比較接近。經(jīng)過選擇,84種合金的ΔGH*絕對值小于0.1eV,84種合金的形成能范圍在?1.80 eV至0.00 eV之間(圖6d)。
表3. 四種HER合金催化劑實(shí)驗(yàn)測量值與預(yù)測值的ηHER比較
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圖6.(a)ML模型預(yù)測期間的RMSE值對訓(xùn)練數(shù)據(jù)集大小依賴性(b) ML模型的k次交叉驗(yàn)證的R2得分(c)MP數(shù)據(jù)庫的2290個數(shù)據(jù)ΔGH*預(yù)測和特征Mc的分布(d)84種合金的ΔGH*分布,其形成能值在-1.8至0.0 eV之間。
接下來,通過DFT計(jì)算進(jìn)一步研究了代表14種化合物的藍(lán)點(diǎn),ML模型可以有效地識別合金成分及其吸附活性位點(diǎn),獲得了ScAu、TbSb、TbCd和TiAu的ΔGH*值,DFT計(jì)算和ML預(yù)測之間的誤差相對較小。
如圖7a所示,ScAu在DFT計(jì)算中表現(xiàn)出優(yōu)異的ΔGH*值,可以達(dá)到0.036eV,ML預(yù)測和DFT計(jì)算之間的誤差值僅為0.002eV。Sc的d軌道和Au的s軌道包含空軌道和不成對電子。當(dāng)吸附劑H與ScAu合金表面接觸時,在空位軌道上形成化學(xué)吸附鍵,達(dá)到分子活化的目的,降低了吉布斯自由能,更有效地完成了HER。
其次,機(jī)器學(xué)習(xí)模型對TbSb預(yù)測性能也較為優(yōu)異,預(yù)測的ΔGH*值為0.009eV,與DFT計(jì)算值0.051eV更為接近(圖7b)。TbCd和TiAu在ML預(yù)測和DFT計(jì)算之間的誤差較小,分別達(dá)到0.033eV和0.060eV(圖7c和d)。比較表明,高性能LGB模型可以準(zhǔn)確模擬H在合金表面的吸附。
根據(jù)以上優(yōu)異的性能,發(fā)現(xiàn)ScAu和TbSb是HER的有前途的電催化劑,并進(jìn)一步驗(yàn)證了使用ML加速方法預(yù)測催化活性的可行性。
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圖7.(a)ScAu(b)TbSd(c)TbCb和(d)TiAu的析氫反應(yīng)DFT計(jì)算和ML預(yù)測的反應(yīng)途徑以及ΔGH*值的比較
結(jié)論與展望
本文設(shè)計(jì)了準(zhǔn)確有效的ML模型來預(yù)測二元合金HER催化劑,共收集了8856條電子和結(jié)構(gòu)特征工程的數(shù)據(jù)作為ML模型的數(shù)據(jù)集,確定LGB算法是性能最好的模型。其中,特征Mc對ΔGH*值影響最大,并呈正相關(guān),新引入的電子和結(jié)構(gòu)位點(diǎn)特征能夠?yàn)榘l(fā)現(xiàn)高性能電催化劑提供必要的物理解釋。
為了進(jìn)一步證明模型的有效性,使用ML對ΔGH*值接近0.0eV的84種合金進(jìn)行預(yù)測,并使用DFT進(jìn)行了計(jì)算,對ML預(yù)測結(jié)果作出了進(jìn)一步的獨(dú)立驗(yàn)證。本工作與DFT計(jì)算相比,提高了高性能合金電催化劑的計(jì)算效率,加快了合金電催化劑的篩選。
文獻(xiàn)信息
Zhang J, Wang Y, Zhou X, et al. Accurate and efficient machine learning models for predicting hydrogen evolution reaction catalysts based on structural and electronic feature engineering in alloys[J]. Nanoscale, 2023.
https://doi.org/10.1039/D3NR01442H
【做計(jì)算 找華算】
計(jì)算內(nèi)容涉及OER、HER、ORR、CO2RR、NRR自由能臺階圖、火山理論、d帶中心、反應(yīng)路徑、摻雜、缺陷、表面能、吸附能。
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